ألقي القبض على متولي، البالغ من العمر 60 عاماً، فى 2017 أثناء توجهه إلى جنيف بسويسرا للمشاركة في الدورة 113 لفريق عمل الأمم المتحدة المعني بالاختفاء القسري؛ بصفته منسقا لرابطة أسر المختفين قسريا، ووالدًا لابن قبض عليه في يوليو 2013 ومازال مختفيا قسريا حتى الآن. وتعرض متولي لممارسة "التدوير" على ثلاث قضايا متتالية لنفس الاتهامات للالتفاف على القرارات الصادرة بإخلاء سبيله ولتبرير تجاوزه لثلاثة أضعاف الحد الأقصى للحبس الاحتياطي.

في 14 أكتوبر 2019 حكمت محكمة الجنايات ببراءة إبراهيم متولي من التهم الموجهة إليه، وأمرت بالإفراج عنه.و تم اتهامه على ذمة قضية أخرى بتهم مشابهه لتهم القضية الأولى. وحكم المحكمة ببراءته في اغسطس 2020، ولكن تم اتهامه في قضية جديدة يوم 6 سبتمبر 2020. ومن القضايا التي أتهم فيها، القضية رقم 786 لسنة 2020 حصر امن دوله، ورقم 1470 لسنة 2019 حصر امن دوله.

ومنذ نقله إلى سجن بدر في نوفمبر العام الماضي -كمحبوس احتياطيا على ذمة القضية 786 لسنة 2022- رفضت إدارة السجن السماح لأسرة متولي بزيارته رغم تقديم عدة طلبات بهذا الشأن ودون تقديم أي من بدائل التواصل المنصوص عليها في قانون السجون.و زاد الأمر سوءًا مع تجديد حبسه ورقيًا دون حضوره الشخصي أمام قاضي التجديد بمحكمة بدر طوال الفترة من 25 يناير وحتى أول مايو الماضي بسبب انقطاع الاتصال بالسجن عقب محاولات انتحار سجناء داخل بدر 3 اعتراضا على منعهم من الزيارة وحرمانهم من حقوقهم كسجناء؛ ما أدى بدوره لغياب أى سبيل لعائلته للاطمئنان عليه داخل السجن حيث إن جلسة التجديد كانت الفرصة الوحيدة لمحاميه للتأكد انه على قيد الحياة ومن ثم طمأنتهم.

في 24 يونيو 2023 سمحت إدارة سجن بدر 3 لأسرته بزيارته وذلك للمرة الأولى منذ نقله للسجن العام الماضي.

في 25 يونيو 2023 قررت محكمة الجنايات المنعقدة بمدينة بدر تجديد حبس إبراهيم متولي، المحامي الحقوقي ومنسق رابطة أهالي المختفين قسريًا، لمدة 45 يوماً آخرين

في 16 يوليو 2023 نظرت الدائرة الأولى جنايات القاهرة، في جلستها المنعقدة، في سجن بدر أمر تجديد المحامي إبراهيم عبد المنعم متولي و محمد عبد الله سلام وذلك على ذمة التحقيقات في القضية رقم ٧٨٦ لسنه ٢٠٢٠

في 10 سبتمبر 2023 تمر اليوم 6 سنوات على اعتقال المحامي الحقوقي إبراهيم متولي الذي تم القبض عليه في 10 سبتمبر 2017، متجاوزًا ضعفي المدة المقررة قانونا للحبس الاحتياطي (عامين) في عصف تام بالقانون، وانتقام ممنهج من محاولاته معرفة مصير أبنه المختفي قسرا منذ 10 سنوات (يوليو 2013)، وجهوده ضمن رابطة أسر المختفين قسرا للكشف عن مصير آخرين.

وأدانت لجنة العدالة و9 منطمات أخري في بيان لهم استمرار احتجاز المحامي إبراهيم متولي تعسفيًا، انتقامًا من عمله الحقوقي المشروع في ملف المختفيين قسرًا وتقديم الدعم القانوني لأسرهم، والانخراط في حملات المناصرة المحلية والدولية لوضع حد لهذه الجريمة؛ نطالب بالإفراج الفوري وغير المشروط عنه، والكشف عن مصير أبنه المختفي قبل 10 سنوات، ووضع حد لجريمة الإخفاء القسري في مصر وتقديم المسئولين عنها للمحاسبة.

في 22 نوفمبر 2023 نظرت الدائرة الأولى إرهاب بمحكمة الجنايات، في جلستها المنعقدة بسجن بدر، أمر تجديد حبس المحامي إبراهيم عبدالمنعم متولي على ذمة القضية رقم 786 لسنة 2020 حصر أمن دولة، بتهمة تأسيس جماعة أثناء ترحيله من وإلى السجن للتجديدات وقررت حبسه 45 يوم .

في 25 مارس 2024 قررت الدائرة الثالثة جنايات إرهاب، في جلستها المنعقدة بسجن بدر ، تجديد حبس المحامي إبراهيم عبدالمنعم متولي على ذمة القضية رقم 786 لسنة 2020 حصر أمن دولة، بتهمة تأسيس جماعة أثناء ترحيله من وإلى السجن للتجديدات وقررت حبسه 45 يوم .