الضحية تم القبض عليه يوم 9 يونيو 2025 من محل إقامته بمدينة العاشر من رمضان بمحافظة الشرقية، دون إبراز إذن قضائي أو سند قانوني.

تم اقتياده إلى جهة غير معلومة، يُرجح أنها مقر جهاز الأمن الوطني بالعاشر من رمضان، حيث تعرض للاختفاء القسري لمدة 13 يومًا، وخلال تلك الفترة تعرض لانتهاكات بدنية ونفسية ، وذلك على خلفية دعمه لقافلة الصمود الهادفة إلى فك الحصار عن غزة، ومواقفه المعلنة الداعمة للقضية الفلسطينية ورفضه للمجازر والانتهاكات التي ترتكب بحق الشعب الفلسطيني.

في 22 يونيو 2025، تم عرض الصحفي مجدي غنيم على نيابة أمن الدولة العليا بالتجمع الخامس، حيث تم التحقيق معه وحبسه احتياطيًا 15 يومًا على ذمة القضية المذكورة، ثم جرى ترحيله إلى سجن أبو زعبل 2.