في 1 نوفمبر 2018 اختطفت قوات الأمن الوطني هدى عبد المنعم عزيز من منزلها في القاهرة ولم تظهر إلا بتاريخ 21 نوفمبر في نيابة أمن الدولة بالقاهرة، حيث اتُهمت " بالانضمام لجماعة إرهابية أسست على خلاف القانون، والتحريض على ضرب الاقتصاد القومي"، ووضعت رهن الاحتجاز على ذمة القضية رقم 1552 لسنة 2018 .

في 5 مارس 2023 أصدرت الدائرة الأولى إرهاب و مقر انعقادها بمجمع محاكم بدر أحكام في القضية رقم 703 لسنه 2021 جنايات كلي القاهرة الجديدة ، رقم 1552 لسنة 2018، حصر أمن الدولة العليا ، رقم 1 لسنة 2021 جنايات أمن الدولة طوارئ المعروفة إعلاميا بالتنسيقية ، ووجهت النيابة للمتهمين تهم الانضمام إلى جماعة إرهابية مع العلم بأغراضها، وحيازة مطبوعات وتسجيلات تتضمن ترويجًا لأغراض الجماعة، وإمداد جماعة إرهابية بمعونات مالية، وارتكاب جريمة من جرائم تمويل الإرهاب، مع العلم بأغراض الجماعة. وفي تاريخ 23 أغسطس 2021، وبعد مرور عامين ونصف على التحقيقات في القضية، أصدر المستشار خالد ضياء، قراره بإحالة القضية إلى محكمة جنايات أمن الدولة طوارئ ، و صدر الحكم برئاسة المستشار محمد السعيد الشربيني على 31 متهم بالقضية ، ومنطوق الحكم على هدى عبد المنهم المحامية الحقوقية ( السجن المشدد ٥ سنوات مع وضع المحكوم ضدهم تحت المراقبة لمدة خمس سنوات بعد انتهاء مدة العقوبة) .

في 10 يونيو 2023 طالبت ابنه المحامية الحقوقية هدى عبد المنعم بالإطمئنان والسماح لها بزيارتها ورؤيتها مؤكدة أنها منذ 3 أشهر لا يعرفون عنها شئ لمنعهم من الزيارة ومنع الجوابات في ظل تدهور لحالتها الصحية ، كما اكدت ابنتها ان محكمة القضاء الإداري بجلسة 10 يونيو 2023 قررت تأجيل جلسة طلب الإفراج عن المحامية الحقوقية هدى عبد المنهم بمرور ثلاثة أربع المدة وقررت المحكمة التأجيل لمدة 4 أشهر .

في 14 يونيو 2023 أعلن المحامي خالد بدوي زوج المحامية والمدافعة عن حقوق الإنسان هدى عبد المنعم ترحيلها إلى سجن العاشر من رمضان وأكد زوجها منعه من زيارتها في سجن العاشر .وهذا نص تدوينته على الفيس بوك : الحمد لله على كل حال ،وإنا لله وإنا إليه راجعون ، منعنا اليوم من زيارة زوجتى الأستاذة : هدى عبد المنعم بعد نقلها لسجن العاشر من رمضان ، ثلاثة أشهر ويزيد من تاريخ جلسة الحكم لا نعرف عنها شيئا غير مسموح حتى بكلمات منها او إليها نتبادل بها الاطمئنان اللهم أنت حسبنا ونعم الوكيل ولاحول ولا قوة لنا إلا بك وحدك لاشريك لك.

في 13 يوليو 2023 قالت فدوى خالد ابنه المحامية الحقوقية هدى عبد المنعم أنه تم منعهم من الزيارة الإستئنائية في سجن العاشر من رمضان " رحنا مركز الاصلاح والتأهيل عشان نشوف ماما انهاردة واتمنعنا من الزيارة بالرغم من وجود زيارة استثنائية في السجن دلوقتي يادوبك دخلنا الاكل بس " .

في 27 أغسطس 2023 قالت فدوى خالد ابنه المحامية الحقوقية هدى عبد المنعم أنه تم السماح لهم بزيارة المدافعة عن حقوق الإنسان هدى عبد المنعم في سجن العاشر من رمضان "زرت ماما وشفتها وحضنتهااااااااااااا" .

في 12 سبتمبر 2023 قالت هند خالد ابنه المحامية الحقوقية هدى عبد المنعم أنه أنه تم منعهم من الزيارة في سجن العاشر من رمضان "بعد انتظار اكتر من ١٠ ساعات اتمنعنا من زيارة ماما - طبلية بس" .

في 31 أكتوبر 2023 تم تدويرها على ذمة قضية جديدة في اخر ايام تنفيذ حكمها وقررت نيابة أمن الدولة العليا بتوجيه تهم سياسية جديدة إلى هدى عبد المنعم، المحامية بالنقض والعضوة السابقة بالمجلس القومي لحقوق الإنسان، وحبسها احتياطيًا 15 يومًا على ذمة قضية برقم 730 لسنة 2020 حصر أمن الدولة العليا.
ووجهت نيابة أمن الدولة إليها اليوم تهمة الانضمام لجماعة إرهابية، وهي نفس التهمة التي قضت محكمة الطوارئ بإدانتها بها ومعاقبتها بالسجن خمس سنوات تنتهي اليوم. كما وجهت النيابة لها مرة أخرى اتهاما بتمويل جماعة إرهابية رغم حصولها على البراءة من هذه التهمة من محكمة أمن الدولة العليا طوارئ.

في 12 نوفمبر 2023 تفاجأ بعض المحامين في النيابة بعرض المدافعة عن حقوق الإنسان (هدى عبد المنعم) قبل موعدها ودون ظهورها على جدول العروض ، العرض تم أونلاين وهي طلبت من رئيس النيابة التأجيل لعدم علم محاميها بالعرض لكنه رفض وتم التجديد ١٥ يوم.

في 16 نوفمبر 2023 قالت فدوى خالد ابنه المحامية الحقوقية هدى عبد المنعم أنه تم السماح لهم بزيارة المدافعة عن حقوق الإنسان هدى عبد المنعم في سجن العاشر من رمضان "الحمدلله الحمدلله ‏بعد آخر زيارة لماما في شهر ٨ ‏دخلونا نشوف ماما ‏الحمدلله الحمدلله " .

في 7 ديسمبر 2023 قررت نيابة أمن الدولة العليا تجديد حبسها 15 يوم على ذمة القضية الجديدة التي تم تدويرها عليها وهي القضية رقم 730 لسنة 2020 حصر أمن الدولة العليا

في 6 يناير 2024 أعلن المحامي خالد بدوي أنه تم السماح له ولأسرة الناشطة الحقوقية بالزيارة داخل السجن

في 5 فبراير 2024 قررت نيابة امن الدولة، في جلستها المنعقدة، تجديد حبس المحامية هدى عبدالمنعم عبد العزيز، وذلك لمدة 15 يوما

في 25 مارس 2024 قررت محكمة جنايات القاهرة المنعقدة بغرفة مشورة تجديد حبس المحامية والمدافعة عن حقوق الانسان هدى بد المنعم 45 يوم على ذمة التحقيق في القضية الجديدة التي تم تدويرها على ذمتها بذات الاتهامات السابق محاكمتها عليها .

في 3 إبريل 2024 أعلنت أبنه المدافعة عن حقوق الإنسان هدى عبد المنعم أنه تم السماح له ولأسرة الناشطة الحقوقية بالزيارة داخل السجن